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甘油磷酸胆碱不仅是肾髓质细胞的主要渗透物之一，而且能够平行的改变细胞内外渗透物质的浓度。这对于脑血管的健康，尤其是有益于因大脑衰退而引起的行为和情感障碍。甘油磷酸胆碱具有对于多种生化病变进行治疗和预防的潜在能力。研究人员发现它可以改变神经元膜中的磷酸盐类脂化合物结构，并且在引发神经组织衰退综合症的相关因素中发现它具有缓解身体紧张性的奇特功效。
甘油磷酸胆碱的理化结构以及相互联系的理化特性，确保了它成为非常对脑组织有益的、能时刻保护脑组织新陈代谢的磷脂类物质。乙酰胆碱可帮助脑部完成记忆、学习等活动。在体内，甘油磷酸胆碱可穿过血脑屏障，这种生化特性为乙酰胆碱的生物合成提供了必要的原料—胆碱。“ 胆碱能损伤假说”，认为胆碱能的活性丧失与阿尔茨海默氏症的严重程度有关。
