长期以来，我国医药加工业都是采用传统的加热干燥、杀菌方式，如采用热风、远红外进行药品的干燥，用高温高压，钴60等进行杀菌。它们不仅热效率利用率低、加热时间长、占地面积大不利于环保。微波在医药业的设备主要应用于药丸、药片、药粉、药颗粒、中药提取物，浸膏及各种口服液、中西药材等的干燥与杀菌处理及中药快速提取设备。可以说微波在烘干设备上运用对于医药行业来说是一个重大的变革。
杀菌要在加压，120℃的高温下，保温20～40分钟，而药品的药效和营养成份必将受到一定程度破坏。而采用微波烘干机干燥、杀菌能充分发挥微波干燥、杀菌特性，就可以解决传统加热的弊端。用精心设计的药丸微波烘干设备，加工的药丸不龟裂，一致性好，保持原样性，延长了保质期。河南勃达微波设备有限责任公司生产的5KW微波口服杀菌的烘干设备，每小时可加工10mL的口服液5000支以上，其杀菌温度仅为80℃左右，时间不到1分钟，不仅卫生指标达标而且口服液色泽清澄、保持了口服液原营养成份、无沉淀、口感佳，该设备已通过制药GMP认证。
此外，微波能使细菌正常生长和稳定遗传繁殖的核酸RNA和脱氧核糖核酸DNA，是由若干氢键松弛，断裂和重组，从而诱发遗传基因突变，或染色体畸变甚至断裂。微波杀菌烘干设备还具有以下两大特点：
（1）节约能源：常规热力杀菌往往在环境及设备上存在热损失，而微波是直接对食品进行作用处理，因而没有额外的热能损耗。相比而言，一般可节电30-50%。
（2）均匀*：常规热力杀菌是从物料表面开始，然后通过热传导传至内部。存在内外温差。为了保持食品风味，缩短处理时间，往往食品内部没有达到足够温度而影响杀菌效果。由于微波具有穿透作用，对食品进行整体处理时，表面和内部都同时受到作用，所以消毒杀菌均匀、*。
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