微波干燥杀菌主要适合于高含水量产品的干燥。由于水的汽化热很高，因此需要相当大的能量才能有效干燥，所以，只在常规干燥不太有效区段利用，微波能才比较经济合理。在含水量大的物料中，尽可能先用机械方法（如吸水、挤压或离心手段）去除水分，然后使用常规热风干燥炉，用热风吹过物料表面来提供所需的汽化热。微波干燥杀菌技术的效率，随着干燥的进行而下降。主要是因为表面蒸发速率越过物料内部水分向表面的迁移速率。于是出现外干内潮的现象。加之一般干燥物料导热低，因而干燥过程变得十分缓慢。结果使得干燥炉有效长度增加、占地增大，而且由于干燥炉体热损失引起能量的浪费。
在干燥速率开始下降的低含水干燥区段，利用微波能的渗透加热特性，可使物料内部的残留水份很快地向表面迁移蒸发。此外，常常也向微波干燥器中鼓入热风，以便更有效地排出水汽‘获得更好的经济效益。
微波干燥杀菌设备主要用于橡胶制品的连续硫化。由于橡胶热传导差，采用常规加热硫化往往需要很长时间，才能使制品整个断面达到所需的硫化温度。而且，常出现表面过硫化或中心欠硫化的缺陷。由于微波干燥杀菌设备微波能的体积加热特性，可在很短时间内将橡胶制品整个断面加热到所需的温度，然后进入一个常规加热的保温通道，其主要目的是防止橡胶在发生硫化反应前冷却，在保温通道中没有热量转移至橡胶中，其效率可由表面的热损耗来控制。在理想情况下，微波干燥杀菌设备系统中产品所需的全部热量都可由微波能提供，但在实际连续生产中，由于挤压速度，橡胶种类和截面积等都变化很大，所以，在某些情况下，只能有大部分能量是由微波提供，而热的平衡仍用常规方法。
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