GeneChip™ O恒河猴基因 1.0 ST 阵列使您能够:
• 检测该片段在整个基因中的表达情况,且分辨率和准确度均高于经典 3'-端偏倚微阵列方案
• 通过对每个转录本进行多次独立测量,获取精确且可重现的数据
背景
对比较基因组学研究、进化生物学而言,模型及应用研究生物拥有巨大价值,并且在破译人类疾病的分子机制及农作物改良方面将持续发挥关键作用。GeneChip Gene 1.0 ST Array 已被开发用于分析各种模型和应用研究微生物。这些生物体是不断壮大的基因表达微阵列家族的成员,可提供全转录本覆盖。GeneChip 基因 1.0 ST 阵列由我们与研究人员合作设计,如 Roslin 研究所遗传学和基因组学部主任 Alan Archibald(猪阵列设计)、干细胞研究计划主管 Leonard Zon 和波士顿哈佛医学院儿童医院干细胞研究项目的基因组核心主任 Yi Zhou(斑马鱼阵列设计)。
关键优势
• 较高的转录本覆盖度 – 对良好注释内容进行可靠的表达测定,每个转录本含高达26个探针
• 全转录组分析 – 可捕获 3’ 端偏倚表达设计可能遗漏的转录本亚型
• 高数据相关性 – 可实现较高的阵列条带间和阵列条带内信号相关性 (R >0.99)
符合行业标准的成熟性能
GeneChip 基因 1.0 ST 阵列实现所选模型和应用研究微生物的全转录组覆盖。所有设计均基于较新的基因组内容,并且提供较高的探针覆盖范围(完整长度基因中可多达 26 个探针)。这使得它可以精确进行全转录组微阵列分析检测,并可提供比市场上其他经典 3'-端偏倚微阵列方案更高的分辨率和准确性。全转录组分析方法使研究人员能够检测多个转录本亚型,包括使用 3’-端偏倚表达设计时可能遗漏的亚型,如剪接变异、非多聚腺苷酸转录本、带有选择性多聚腺苷酸化位点的转录本以及截短转录本。
完整的试剂、软件和仪器解决方案,实现更好的阵列性能
为提供方便及完整支持、将 Gene 1.0 ST Array 作为全面解决方案(包括 GeneChip 试剂和仪器)的一部分:
•GeneChip WT Sense 目标标记和对照试剂。有关检测程序和性能的详细信息,请参阅 WT Sense 目标标记分析手册
• GeneChip 射流工作站 450 可进行完整的自动阵列处理,以获得较高水平的重现性
• GeneChip 扫描仪 3000 7G,带可选的自动加载器,可用于阵列图像采集
我们提供多种工具来帮助您进行数据分析,包括 GeneChip Expression Console;软件、NetAffx 分析中心和集成基因组浏览器 (IGB)。
Expression Console 软件是易用型应用程序,可实现探针集汇总和初步数据质量评估。简单的工作流程使得用户能够快速分析数据(见图)。使用 GeneChip 兼容™ 软件供应商提供的软件应用可以进一步分析所得数据。
NetAffx 分析中心(对探针组生物学和功能注释进行定期更新)是特别全面的阵列注释和探针序列信息资源库。灵活的查询工具和外部链接使研究人员能够深入研究感兴趣的基因和注释。该资源便于轻松解读微阵列结果和快速设计下游研究。工作流程
研究人员还可以使用 IGB 来获得基因组的可视化结果。基因组注释(包括不同来源的 RefSeq 序列、SNP 和基因组位点)可以与微阵列基因表达信号数据一起查看。
基因 1.0 ST 阵列数据分析工作流程类似于 3' 基因表达分析的工作流程,利用 NetAffx 分析中心中的 Expression Console 1.1、兼容 GeneChip 的第三方软件和注释工具以及 IGB。
内容概况
GeneChip 基因 1.0 ST 阵列具有较新的转录基因组覆盖范围。我们使用全面的信息源来设计用于检测每个转录本多达 26 个序列的探针。全部这些 26 种的 25-mer 探针可检测每个转录本至多 650 个碱基。整个转录本的高探针覆盖度带来了出色的性能和数据可信度,同时也能够随着您对每个基因组和转录组的理解加深时更新您的实验数据。
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.