Oncomine TCR Beta-SR Assay 是一种稳定的下一代测序 (NGS) 靶向检测试剂盒,旨在准确识别和测量福尔马林固定-石蜡包埋 (FFPE) 样本中 T 淋巴细胞的克隆扩增。这些检测试剂盒通过靶向检测基因组 DNA 或 RNA 中的 T 细胞受体 (TCR) 基因点位不同的互补性决定区 3 (CDR3) 来识别的 T 细胞克隆。CDR3 区的核苷酸序列对于每个 T 细胞克隆均且编码 TCR β 链属于抗原识别的一部分。该特定检测试剂盒适合与 RNA 样本配合使用。有关 DNA 样本,请参阅货No. A39072。
Oncomine TCR Beta-SR Assay - RNA 的优势包括:
•兼容多种样本类型,包括 FFPE 组织、新鲜冷冻 (FF) 组织、全血、PBL 和 PBMC
• 少量样本输入
• 克隆数据仅用于分析有用的重排信息
• 通过双条形码索引,实现罕见克隆鉴定的高灵敏度和低检测限 (LoD) 检测
• 高效的工作流程,不到 48 小时就能获得样品结果
• 灵活的样品输入,介于 50 ng 到 1 μg
• 简化和用户友好的信息学解决方案,具有多样品分析功能
Oncomine TCR Beta-SR Assay - RNA 使用多重 PCR 引物生成 80-bp 扩增子,能够使用 Ion GeneStudio S5 测序系统支持的所有芯片类型进行测序,从而可以根据您的样品批量处理需求和通量要求,选择理想的多重检测配置。使用 Ion Chef 模板制备系统和 Ion GeneStudio S5 系统,只需 2 天即可完成从 RNA 分离到样本分析的整个工作流程(下图)。检测试剂盒提供一组多重 PCR 引物和文库试剂且与 FFPE 组织、冷冻 (FF) 组织、全血、PBL 和 PBMC 中的 RNA 等样本类型兼容。
Oncomine TCR Beta-SR Assay - RNA 支持免疫肿瘤学和血液肿瘤学研究领域的关键应用。该试剂盒具有高灵敏度双条形码索性、灵活的样品起始量要求 (50 ng–1 μg)、高深度测序以及高通量等特征,是血液 T 细胞恶性肿瘤患者微小残留病变检测的理想选择。该检测试剂盒具有的 FFPE 相容性,研究人员能够重点关注肿瘤微环境中的 T 细胞浸润和克隆性。测量肿瘤微环境中的 T 细胞有助于生物标志物发现和监测个体对检查点阻断抑制剂、癌症疫苗或嵌合抗原受体 (CAR) T 细胞疗法等免疫疗法的应答。
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注:有关使用 Ion Reporter 软件 v5.10 进行数据分析的信息,请参见下面的《用户指南》。