集菌仪和微生物限度检测仪主要都是用作微生物检测用，中国药典里面有明确的对应无菌产品为检测使用集菌仪配套耗材使用的是一次次集菌培养器，做无菌检测。对于非无菌产品的检测使用微生物限度检测仪，做限度检查。

1、集菌仪是做无菌检测的，微生物限度检测仪是做有菌检测，二者都是薄膜过滤法。

2、集菌仪是集菌培养器的配套使用仪器，通过集菌仪的定向蠕动加压作用，供试品被过滤并在滤器内进行培养，以检验供试品是否含菌。集菌仪的作用是检验供试品是否含菌的仪器，配套集菌培养器使用。主要用于注射用无菌制剂的无菌检测，包括抗生素类及含有抑菌成份的药品、大输液、水针剂、灭菌医疗器具、无菌注射用水等。

微生物限度检测仪一般采用不锈钢金属材料制成，配有内置或外置隔膜液泵，将供试品注入微生物限度培养器内，通过检验仪自的隔膜液泵负压抽滤，将供试品中微生物截留在滤膜上，用取膜器取出滤膜，转移至配置好的固体培养基上，菌面朝上，平贴。盖上盖子形成封闭的培养盒，置于相应的恒温培养箱内培养并计数。内置泵的微生物限度仪使用起来比较方便比如MT-302P 微生物限度检查仪客户选择的就比较多。

3、价格方面集菌仪相对于微生物限度检测仪贵，微生物限度检测仪比较便宜。

特别提醒集菌仪可以用来做限度检查使用，只是使用起来比较麻烦，另外配套的限度过滤杯是开拆卸的。过滤完成后，滤膜可以取出来。转移到培养基上再进行培养。

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