分子蒸馏系统是一种较新的分离技术，它利用分子在高真空条件下的平均自由程差，在远低于沸点的温度下分离液-液混合物。

　　当液体混合物沿着加热板流动并被加热时，轻分子和重分子将离开液体表面并进入汽相。轻分子和重分子在气相中的平均自由程不同，所以它们的移动距离也不同。假设我们在适当的位置放置冷凝板，轻分子可以到达冷凝板并被冷凝，然后沿着冷凝板排出;而重分子不会到达加热板并沿加热板排出。从而达到了分离的目的。

　　分子蒸馏较传统蒸馏具有明显的技术及经济优势：

　　1 、 产品质量高。由于分子蒸馏操作温度低、受热时间短，可以获得纯度高而且原有品质保持好的产品，对于天然物质尤其重要。

　　2 、 产品成本低。由于分子蒸馏的分离效率高、产品得率高，从而可大大降低生产成本。

　　分子蒸馏技术的应用特点：

　　一，可有效地脱除热敏性物质中轻分子物质

　　(1)产品物质的脱臭，姜油的脱臭。

　　(2)产品物质的脱溶，辣椒红色素的脱溶。

　　(3)产品物质中脱单体，酚醛树脂中单体酚的脱除。

　　二，脱除产品中重物质及颜色

　　精细化学品中常常有一些重分子物质、甚至金属离子等难以分离，分子蒸馏为此提供了有效方法。

　　其它如芥酸、、亚麻酸、二聚酸、芥酸酰胺、硬脂酸单甘酯、高碳醇的精制及脱色，也需要采用分子蒸馏技术。

　　三，降低热敏性物质热损伤

　　鱼油乙酯脱色及浓缩。

　　不仅产品得率高，而且产品品质好，绝大多数的天然或合成香精香料都属于热敏性物质，均适合采用分子蒸馏技术提纯。

　　四，改进传统工艺，进行清洁生产

　　鱼油甘三酯精制。

　　省去了传统工艺中碱炼法脱酸， 不但避免了皂化液对环境的污染， 变废为宝， 而且提高了主产品质量。

　　其它类似产品有小麦胚芽油、米糠油、椰子油、大豆油脱酸等。

　　废润滑油回收。

　　传统工艺除去重杂质的方法为硫酸法，该方法对环境污染很大，发达国家均已经禁止，而采用分子蒸馏技术则可防止污染，变废为宝。

　　五，优化产品的合成工艺，提高产品的质量

　　烷基多苷精制。

　　烷基多苷合成工艺中，脂肪醇过量有利于合成反应，但又直接影响产品纯度，采用分子蒸馏可有效脱醇，使合成工艺中脂肪醇的使用可根据工艺需要而定，提高了产品收率和质量。