环保节能型水源温湿调控机组具备制冷和温湿度调控两种运行模式，根据库房温湿度状态、自动选择高速制冷或调温除湿模式，其运行调温除湿模式无需消耗额外的电功率，也不会像除湿机系统额外增加库房的冷负荷。

在环保节能型水源温湿调控设备内部就可实现制冷剂（氟利昂）的压缩、冷凝、节流和蒸发换热等循环，氟利昂循环的过程就是热量转移的过程，通过在蒸发器中的蒸发吸热（将库房中的热量带走）和在壳管式换热器中将热量传递给冷却水然后通过冷却塔散热到室外，从而达到制冷的目的，另一方面在温湿度调控模式下库房中的循环空中在蒸发器翅片处通过与蒸发的氟利昂充分的进行热交换，使循环空气的温度达到露点温度以下，将空气中过多的水蒸气以凝结水的形式在蒸发器的翅片处析出，并通过冷凝水的方式排至室外从而达到调温除湿的目的（在此模式下根据库房温度状态可自动的选择是否利用冷凝废热对送风温度进行调节）。