临床实验室用水应依照相应的水质标准，其中zui相关的是美国临床实验室标准研究所(CLSI)标准中的I型纯水，美国、日本、欧洲的药典也是很常用的标准。临床分析仪供水或在任何制备和分析程序中的用水，都应使用结合多种纯化技术制成的高品质纯水。实验室超纯水机应运而生。

临床分析仪用水纯度要求应依据分析仪制造商的设置而定，但通常电阻率应大于10MΩ.cm@25℃,TOC小于50ppb以及细菌水平小于5CFU/ml。不同的实验目的灵敏度要求也不同，它决定了试剂制备或稀释用纯水的等级。对很多普通化学应用，灵敏度不是首要因素，实验室Ⅱ级纯水就已经具备了足够好的纯度。在此基础上结合去离子技术就可得到很低离子含量的超纯水，结合UV灯、过滤和循环管路等手段，还可以很好地控制有机物和微生物水平。*的现代分析仪器不断提升分析的灵敏度。痕量元素现在通过使用诸如ICP-MS技术，可测定在ppt和亚ppt水平的物质。