空气热交换器使用时间长了，因为结垢或一些杂质阻塞通道，会使换热作用下降，进出口压差加大，呈现这些现状时，空气热交换器就要思考清洁了。空气热交换器的保护需要由专业的公司来进行，包含空气热交换器清洁、空气热交换器修理、空气热交换器板片创新、空气热交换器密封垫替换、空气热交换器扩容等。
清洁方法有两种，一种是循环清洁即是通过循环泵把清洁液（清洁液能加热作用非常好）打进板换里进行循环，这种方法对结垢后的清洁作用较好。若板换通道被杂质阻塞时就只有拆开来清洁了，松螺母前先量好夹紧尺度并记载下来，然后对角松开螺母，把夹紧板向后推至后支持处板片就可以拿出来清洁了，清洁结束后从新安装上去（若密封胶垫有损坏则需替换新的胶垫），对角夹紧到记载的尺度上即可。种清洁方法的优点是清洁对比方便，不足之处是清洁不行洁净。第二种清洁方法的优点是可以把板片清洁的很洁净，不足之处是拆装对比费事，可能要替换密封胶垫。