从医学角度看，二甲基亚砜（DMSO）是一种有多种用途的化合物，可以治疗膀胱感染，皮炎和高血压等疾病。处方二甲基亚砜有口服，静脉注射和软膏等不同形式。一些制药厂也生产非处方品种，不过在有些国家，这类二甲基亚砜版本并没有得到核准使用。医生可以帮助病人判断这种药物是否适合治疗他们的特殊疾病。

遵循医生处方使用二甲基亚砜出现副作用的概率低。常见的副作用包括局部皮肤干燥，晕眩，和呕吐等。偶尔会出现过敏反应，并有可能导致皮肤发炎和呼吸困难。有些研究还认为大剂量使用二甲基亚砜容易进一步造成肝脏和肾脏问题。

在一些保健品卖店可以买到非处方二甲基亚砜。但通常不建议不医生就接使用这类软膏或营养补充剂，因为对这类非处方药物的作用还没有充分认识。这些药物所含活性成分也各有不同，过量使用有可能损害大于好处。此外，这种化合物还会增加或改变其他药物效果，引起难以预料的负面影响。

尽管自身就有药物疗效，但这种化合物经常用于卫生保健机构的药物输送系统。处方二甲基亚砜通常被作为抗炎剂静脉注射，治疗膀胱感染和高血压。这种药物治疗其他疾病的有效性还没有得到足够的临床研究确认，但多医生认为二甲基亚砜还有减少神经痛，愈合伤口，缓解头痛，控制关节痛的作用。

在二甲基亚砜的医疗特性得到广泛认识之前，它的主要作用是作为化学溶解用于工业生产。从20世纪60年代开始，医疗人员开始探索这种化合物的生物应用，发现它具有不造成刺激和损坏渗透进皮肤组织的能力。已知二甲基亚砜还有助于提高其他外用药物的效力（如和抗真菌软膏），能够在不影响皮肤的情况下达到目标。口服或静脉注射形式的二甲基亚砜还有助于促进药物被内部器官吸收。