灵芝粉和灵芝孢子粉同属于灵芝，但属于不同部分。两者的功效成分相似，多都为灵芝多糖和灵芝三萜等，但含量高低不同。通常灵芝孢子粉的功效成分含量要高于灵芝粉2-3倍。
灵芝粉是灵芝实体（盘状菌盖或菌柄）经专业设备粉碎后的粉末，粉末的颗粒细度越细，药用效果和吸收效果就越好。通常灵芝粉的颗粒细度在80-200目之间，如果超过200目，又叫灵芝超细粉，药理活性更加理想。灵芝粉颜色呈土黄色，溶水性较差，苦味略重，市场销售价格也较低。
灵芝孢子粉是灵芝的繁殖细胞，即灵芝的种子，单一种子大小只有5-11微米，外有坚硬的细胞壁壳，为几丁质物质，人体难以消化。灵芝孢子粉中保留了灵芝有价值的药理成分，如果直接服用，吸收率大约只有20%，而经过破壁后，人体吸收率可达到100%。破壁后的灵芝孢子粉又叫破壁灵芝孢子粉或灵芝孢子粉（破壁）。破壁后的灵芝孢子粉颜色呈棕色，溶水性较好，苦味程度视三萜酸含量高低，由弱至强，如果孢子粉越苦，说明药用效果越好。气味方面，如果呈现油蒿味，说明孢子粉已经开始氧化，高质量的灵芝孢子粉应当带有中药天然的淡香味。