中药微波干燥杀菌设备是利用微波能对中药进行干燥杀菌。微波是一种频率非常高的电磁波，其频率在300MHz至300kMHz之间，波长在1m到1mm之间。电磁波波长大于1m为无线电波，小于1mm为光波。微波在传输过程中遇到不同种类的物质会产生反射、透射和吸收现象。  

    通常，一些介质材料由极性分子和非极性分子组成。在微波电磁场的作用下，介质中的极性分子从原来的热运动状态转为跟随微波电磁场的交变而排列取向。例如，采用的微波频率为2450 MHz，就会出现每秒24亿5千万次交变，分子间就会产生激烈的摩擦。在这一微观过程中，微波能量转化为介质内的热量，使介质温度呈现为宏观上的升高，这就是对中药微波加热干燥zui通俗的解释。

    中药微波杀菌的原理是两方面的，它既有热效应杀菌，又有非热效应杀菌，因此它具有双重杀菌功能。中药微波加热干燥时，细菌体内的蛋白质、核酸成分等分子极性集团，在微波场下高速旋转、振动，一方面加热使细菌蛋白质凝固而死亡；另一方面也可以使蛋白质、核酸变性而死亡。

    利用脉冲调制的微波能对中药进行杀菌试验，可以用较小的温升达到杀菌的目的。这说明中药微波杀菌不只是热力杀菌，还有非热力致死细菌的能力，这就是所谓的非热效应。根据这个原理，可以在极短的时间内采用高于常规微波场能量密度的数倍或数十倍的脉冲微波能量，不但可以可靠杀死中药细菌，还可大大降低中药药物温升，降低整个微波设备的能耗。