凝胶过滤色谱：
一般来讲，凝胶过滤色谱的结果好坏直接取决于凝胶柱的柱效，而影响柱效的因素有：
凝胶本身性质：
每一种凝胶均有其合适的分离范围，应选择合适的凝胶进行分离。同样分离范围的凝胶颗粒越细的，柱效越高。
色谱柱装填的好坏：
凝胶过滤色谱柱装填完后，一般可以用丙酮（或NaCl）测定柱效和峰对称性，一般对于平均颗粒直径在30~34微米的Superose PG、Superdex PG系列凝胶，柱效应在9000以上，而颗粒平均直径在90微米的Sepharose FF凝胶柱效应在3000以上。通常，越是分辨率高的细颗粒凝胶对于装柱的技术要求越高。
除了柱效以外，影响分离的因素主要有：
1、色谱柱的长短，一般较长的柱分离较好，L/D>20.但一般商用色谱空柱长100cm左右，zui多可以装到90~95cm高左右，如果仍不能取得满意的分辨率，可以用两根相同的凝胶柱，用SRTC-2接头连接后，可以提高分辨率40%.
分离度正比于柱长的平方根。
2、样品浓度，在蛋白浓度小于50mg/ml并且粘度小于5cP（厘泊）的条件下，样品浓度对于分辨率影响较小。
3、上样体积：
上样体积越小分辨越好，不同的凝胶具有不同的推荐上样体积，如下：
凝胶类型 推荐上样体积（%Vt）
Sephadex 2-5%
Sepharose 2-5%
Sephacryl HR 1-2%
Superdex PG 1-2%
Superose PG 1-2%
Superdex 0.5%
Superose 0.5%
对于利用Sephadex G25进行蛋白质脱盐的特殊情形，样品量达到柱体积的25%仍可以保证蛋白与盐分开。
4、洗脱流速：
一般较低的流速下（5~10cm/h）分辨率较高，但Superdex PG,Sepharose FF等新型凝胶可以在较高的流速下分离而不致损失分离度。

注：本文色谱的主要影响因素属于蛋白质纯化文章，主要介绍色谱方面的知识，内容仅供学习交流与参考.