全自动生物发酵罐可用于发酵多种物质，常见的如下：

1. 抗生素：如青霉素、红霉素等。

2. 氨基酸：例如谷氨酸等。

3. 酶制剂：包括糖化酶等。

4. 维生素。

5. 有机酸：像柠檬酸、黄原胶等。

6. 酒类：啤酒、葡萄酒、醋等的发酵。

7. 疫苗：部分疫苗的生产过程需要使用发酵罐。

8. 双歧杆菌：可有效增加肠道内有益菌群。

9. 有机废弃物：可用于处理有机废弃物，将其转化为可再生能源等。

10. 基因工程和生物技术研究：在一些基因工程和生物技术研究中，会利用发酵罐产生重要的生物化学产物。

此外，在污水处理中，也可利用全自动生物发酵罐处理污水中的有机物质。具体能够发酵的物质还取决于发酵罐的设计、控制系统以及所需的发酵条件等因素。在使用时，需根据特定的微生物和发酵工艺要求，设置合适的参数，以确保发酵过程的顺利进行和产物的质量。同时，不同的发酵物质可能需要对罐体进行特殊的处理或采用特定的配件，以满足其生产需求。不同类型的全自动生物发酵罐在适用范围和功能上可能会有所差异。