xMHC这段区域长度从HLA工类区域zui远端的HCP5P15算起，zui终扩展到HLAⅡ类区域的接近着丝粒处的KIFCI，共7．6Mb，包括下列5个亚区及421个基因座位。

（1）扩展的I类亚区（extendedclassⅠsubregion）：长3．9 M山含有182个基因座位。
（2）经典的I类亚区（classicalclassⅠsubregi。n）：长1．9 Mb，含有122个基因座位。
（3）经典的Ⅲ类亚区（claSSicalclassⅢsubregi。n）：长0．7 Mb，含有62个基因座位。
（4）经典的Ⅱ类亚区（classicalclassⅡsubregion）：长0．9 Mb，含有34个基因座位。
（5）扩展的Ⅱ类亚区（extendedclassⅡsubregion）：长0．2 Mb，含有21个基因座位。

所有基因可归纳为四种类型：
①表达基因（expressedgene）：此类基因可转录成mRNA，有一个稳定的开放阅读框（ORF）和已知蛋白产物。共252个，占421个基因的59．9％。
②后选基因（gene candidate）：此类基因可转录成mRNA，有不明确的ORF，可有或无编码蛋白质的序列。
③非编码基因（non-codinggene）：此类基因有mRNA，无任何ORF，也无蛋白产物表达。共30个，占7．1％。
④假基因（pseudogene）：此类基因一般不能转录成mRNA，可能是一个基因结构片段或是一个交换后（retrotransposed）和未处理的cDNA结构。共139个，占33．0％。