长期停水保养适用于停水保养超过15天的系统，此时必须用维修液(杀菌剂)给水设备加水进行保养。常见的异噻唑啉酮20mg/L，去离子水设备杀菌剂配方为甲醛10，亚硫酸氢钠。一般情况下2~10个月进行一次清洗，假设每个月必须清洗，这就是需要改进的预处理系统，调节运行参数。假设1~2个月需要清理一次，那么需求提高了设备的运行水平，是需求改进预处理系统的难度更大吗?一般情况下，反渗透设备膜会受到无机物垢、胶体、微生物、金属氧化物等污染，这些物质沉积在膜表面会导致清水反渗透设备出力或脱盐率降低，压差增大，甚至对膜形成不可逆的损伤，因此，脱盐水设备为了达到良好的透水除盐功能，需要对膜进行化学维护清洗。反渗透设备经常进行大流量、低压力、低pH的冲刷，有利于去除附着在膜表面的灰尘，维持膜的功能，或者当反渗透设备进水SDI增加超过5.5以上时，应进行低压冲刷，待SDI值调整合格后再运行。