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PromethION是一款桌面测序仪,利用的纳米孔测序技术,实现对DNA和RNA分子的高通量单分子实时测序。
1.应用广泛:全基因组测序、靶向测序、RNA测序、宏基因组测序、表型研究等。样本类型包括人类基因组、动植物基因组、微生物基因组以及各种临床标本的DNA和RNA
2.测序起始量需求从pg级到ug级都可以进行建库。
3.配合快速建库试剂盒使用,可以在10分钟之内完成文库的制备。
4.集成设备:PromethION本身集成了一台高性能计算机,可用于数据获取,存储以及碱基转换(basecalling。
5.安装简便:没有复杂的激光或光路系统,插电即可使用。
6.产生数据快速:提供的单分子实时测序,上机后2分钟产生碱基序列数据。并可以根据实验需求设置测序反应时间,可选范围在几分钟到48小时之间。
7.模块化设计:允许同时运行多至48个独立的实验,也可以单独运行1个测序实验,为用户提供了实验设计上的便利。
8.单分子测序:DNA/RNA直接测序,无需PCR扩增,免除PCR扩增带来的错误和GC偏差,DNA平均测序速度为450bp/s,快速、实时。
9.读长长:读长为核酸片段长度,最长超过2Mbp。
10.数据量大:单张芯片产生200G数据,48张芯片可产生48*200G数据。
11.直接RNA测序:提取RNA无需转换成cDNA即可进行测序。
12.甲基化检测:碱基修饰基于电信号的差异检测碱基,在DNA/RNA测序同时可直接检测碱基修饰。
13.分析软件丰富:数据分析工作站预先安装了30多种可用于分析Nanopore测序数据的常用工具。