两端式洁净室将一定空间范围内之空气中的微粒子、有害空气、细菌等之污染物排除，并将室内之温度、洁净度、室内压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内，而所给予特别设计之房间。

两端式洁净室是污染控制的基础，没有洁净室，污染敏感零件不可能批量生产。在FED-STD-2里面，洁净室被定义为具备空气过滤、分配、优化、构造材料和装置的房间，其中特定的规则的操作程序以控制空气悬浮微粒浓度，从而达到适当的微粒洁净度级别。

净化车间一般包括净化区、准净化区和辅助区三部分。

洁净室的平面布置可以有以下几种方式：
外廊环绕式：外廊可以有窗和无窗，兼作参观和放置一些设备用，有的在外廊内设值班采暖。外窗必须是双层密封窗。
内廊式：净化车间设在外围，而走廊设在内部，这种走廊的净化度级别一般都较高，甚至和净化车间同级。
两端式：净化区设在一边，另一边设准净化和辅助用房。
核心式：为了节约用地、缩短管线，可以净化区为核心，上下左右被各种辅助用房和隐蔽管道的空间包围起来，这种方式避开室外气候对净化区的影响，减少了冷热能耗，利于节能。